Nội dung trong phim Ninja Kamui là câ chuyện xoay quanh về nam nhân vật chính có tên gọi là Joe Higan, bản thân anh ta được biết đến là một Nukenin, đó là một cựu ninja đã trốn thoát khỏi gia tộc của mình và đang trốn tránh quá khứ bạo lực của mình ở vùng nông thôn nước Mỹ cùng gia đình. Một đêm nọ, anh bị phục kích bởi một nhóm sát thủ từ tổ chức cũ của anh, những kẻ đã gây ra một quả báo đẫm máu đối với Joe và gia đình anh vì đã phản bội mật mã cổ xưa của họ và cũng từ đó mà câu chuyện xoay quanh anh ta cũng được bắt đầu từ đây.
Thoát khỏi cái chết dường như của mình, Joe sẽ tái xuất với tư cách là con người cũ của mình và lấy biệt danh là Ninja Kamui, với sự trở lại lần này thì anh ta xuất hiện để trả thù cho gia đình và bạn bè. Kamui là một ninja của thế kỷ 21, một kẻ lỗi thời trong bóng tối, người sử dụng các kỹ năng cổ xưa của mình để chống lại vũ khí công nghệ cao với sự khéo léo tàn bạo. Anh ta phải đối đầu với những sát thủ được huấn luyện, chiến đấu với người máy và các ninja đối thủ để hạ bệ chính gia tộc đã tạo ra anh ta. Câu chuyện trong bộ anime Ninja Kamui này sẽ diễn ra như thế nào đây? Cùng đón xem bộ anime này để theo dõi nhé các bạn.