Sau khi phần một kết thúc thì bộ anime cũng đã nhận được rất nhiều sự quan tâm đến từ khán giả, chính vì vậy mà sau ba năm Studios: Arms lại một lần nữa cho trình làng phần thứ hai của bộ anime Bách Hoa Liễu Loạn, phim cũng được lấy tên gọi chính thức là Hyakka Ryouran: Samurai Bride. Nội dung trong phim là câu chuyện xoay quanh về một samurai trẻ có tên là Muneakira Yagyuu đã được cử đến Trường Học thuật Buou. Được điều hành bởi Mạc phủ Tokugawa, ở đây con cái của các chiến binh được cung cấp nền giáo dục quý tộc cần thiết để điều hành đất nước. Ngôi trường được dẫn dắt bởi chủ tịch hội học sinh Yoshihiko Tokugawa và chị gái của ông là Sen, người cũng là bạn thời thơ ấu của Muneakira. Khi đến học viện, Muneakira thấy mình đang ở giữa một cuộc chiến khủng khiếp.
Cũng vào thời điểm đó trong lúc hỗn loạn, bầu trời lấp đầy bởi một thứ ánh sáng trắng kỳ dị và một cô gái bí ẩn tên là Juubei Yagyuu xuất hiện và bất ngờ hôn Muneakira đã khiến cho anh vô cùng bất ngờ vì những hạnh động của cô gái kì lạ kia. Với nụ hôn của anh, cô đánh thức một sức mạnh vô danh bảo vệ họ. Cô gái này là ai, và cô ấy đến từ đâu? Muneakira thấy mình bị vướng vào vận mệnh của đất nước và một mối đe dọa sẽ làm rung chuyển cả nước Nhật Bản vĩ đại. Anh ta phải tìm hiểu bí mật đằng sau Master Samurai và nụ hôn đã đánh thức sức mạnh của Juubei để bảo vệ đất nước của mình. Cùng đón xem phần thứ hai của bộ anime này xem điều gì sẽ xảy ra nhé các bạn.